A Nemzeti Információs Infrastruktúra Intézet által
a Pécsi Tudományegyetemre 2011 januárjában telepítendő
nagyteljesítményű számítógép fő adatai
2010. november 10.
1.0
Az információ forrása: az NIIFI által a közbeszerzési eljárásban elfogadott győztes ajánlat.
Közreadja:
Dr. Koniorczyk Mátyás tudományos munkatárs, Pécsi Tudományegyetem,
(kmatyas --at-- gamma.ttk.pte.hu, +36203822662),
Dr. Máray Tamás, az NIIFI szuperszámítógép referensének szóbeli engedélyével.
A berendezések és kapcsolódó alkatrészek leszállítása: legkésőbb 2010. december 28-ig, installáció, sikeres tesztüzem lezárása a szállítási határidőt követő 4 héten belül: 8 hetes szállítási határidő esetén: 2011. január 25-ig, ez az időpont egyúttal a sikeres tesztüzem lezárása és a végső átadás-átvétel időpontja is, amely a 6 éves támogatási időszak kezdete.
A hozzáférést a NIIFI-től kell igényelni, hasonlóan a jelenlegi rendszerhez. A pécsi felhasználók feladatai prioritást élveznek, de a rendszert bármely magyar kutató használhatja. A pécsi felhasználók is használhatják a szegedi clustert és a debreceni MPP architektúrát. Az elérés az akadémiai hálózat bármely gépéről lehetséges lesz (Windows, Linux és Mac gépekről is). A részletek később kerülnek ismertetésre.
A berendezés egy SGI UltraViolet 1000 alapú rendszer. Ez NUMA architektúra: a rendszerben lévő modulok olyan speciális kapcsolattal vannak összekötve, amely gondoskodik arról, hogy a teljes rendelkezésre álló memóriát minden egyes processzor egy egységes címtérben ki tudja címezni. A speciális kapcsolat hardveresen biztosítja a cache koherenciát, valamint gondoskodik arról, hogy a memóriaelérés sebessége és látenciája lehetőség szerint független legyen a processzor és a memória elhelyezkedésétől a rendszeren belül.
A felhasználó szempontjából tehát a rendszer egyetlen számítógépnek látszik, amelyben
192 darab Intel X7542 Xeon Processzor, 6 core/2.66Ghz/18M/5.86GT/s, összesen 1152 db processzor mag
1536 x 4GB DDR3 rendszer memória, vagyis 6144 GB teljes megosztott memória
áll rendelkezésre.
(Idézet a győztes ajánlatból)
UV 1000 1152 magos, X7542 (6magos, 2,66Ghz) CPU
|
HPL |
|
|
RandomAccess |
|
|
HPL_Tflops |
10,5 |
|
MPIRandomAccess_GUPs |
0.5 |
|
|
|
|
StarRandomAccess_GUPs |
0,01 |
|
PTRANS |
|
|
SingleRandomAccess_GUPs |
0.02 |
|
PTRANS_GBs |
60 |
|
|
|
|
|
|
|
b_eff |
|
|
DGEMM |
|
|
MinPingPongLatency_usec |
0.8 |
|
StarDGEMM_Gflops |
8,4 |
|
AvgPingPongLatency_usec |
2.4 |
|
SingleDGEMM_Gflops |
9,2 |
|
MaxPingPongLatency_usec |
3.4 |
|
|
|
|
MinPingPongBandwidth_GBytes |
4.0 |
|
STREAM |
|
|
AvgPingPongBandwidth_GBytes |
4.5 |
|
StarSTREAM_Copy |
1.9 |
|
MaxPingPongBandwidth_GBytes |
5.3 |
|
EP_STREAM_Scale |
2.2 |
|
NaturallyOrderedRingLatency_usec |
3.4 |
|
StarSTREAM_Add |
2.4 |
|
NaturallyOrderedRingBandwidth_GBytes |
0.3 |
|
StarSTREAM_Triad |
2.5 |
|
RandomlyOrderedRingLatency_usec |
5.8 |
|
SingleSTREAM_Copy |
3.7 |
|
RandomlyOrderedRingBandwidth_GBytes |
0.04 |
|
SingleSTREAM_Scale |
5.1 |
|
|
|
|
SingleSTREAM_Add |
5.4 |
|
|
|
|
SingleSTREAM_Triad |
5.5 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
FFT |
|
|
|
|
|
MPIFFT_Gflops |
70 |
|
|
|
|
StarFFT_Gflops |
1.0 |
|
|
|
|
SingleFFT_Gflops |
1.3 |
|
|
|
A háttértár három egységből áll, minden egységben 165 Tbyte áll a felhasználók rendelkezésére, tehát összesen 495 Tbyte használható. Az egységek belül redundáns, Raid 6 szervezésűek. A tároló egységek 8Gbit/s sávszélességű kapcsolattal kapcsolódnak a számító egységhez.
A rendszer 3 darab 24 inch-es vízhűtéses szekrényből és 2 darab 19 inch-es léghűtéses rack szekrényből áll. Előbbiekben a számítási egységek találhatók, tömegük egyenként 1134 kg. A másik két szekrény a tároló és vizualizációs egységeket tartalmazza, tömegük 780 kg ill. 475 kg.
A rendszer maximális villamos fogyasztása 59.9 kW, a valós várt fogyasztás 44-49kW körüli érték.
A rendszer tartalmaz egy Altix XE 500 vizualizációs szervert, amely a következő komponensekből épül fel:
2 socket Intel Xeon Westmere-EP5650, 12 cores / 2.66GHz,
96 GB memória (8GB/core),
2 db 300GB SAS diszk
1db 2 port 8Gbit FC HBA card
1db 1 port 8Gbit FC HBA card
1db 2 port 10Gb ethernet kártya
1 Nvidia Quadro FX 5800 kártya.
A szoftverkörnyezetet elemei
Linux SLES 11 OS
NVidia grafikus driver
Nyílt forráskódú- VirtualGL csomag TurboVNC/TigerVNC szerver és kliens öszetevőkkel.
Nyílt forráskódú Paraview SW (ww.paraview.org)
Open source software Blender (www.blender.org)
A vizualizációhoz két munkaállomás is telepítésre kerül a PTE-n (elhelyezésük még tisztázandó), de bármely, megfelelő paraméterű gépről használható lesz a rendszer.
(Idézet a nyertes ajánlatból.)
A rendszer korlátlan időtartamú és korlátlan felhasználó számú Novell SLES 11 licenszel kerül leszállításra. Ajánlatunkban vállalunk egy SLES 11 adminisztrátor oktatás megtartását.
Az ajánlott rendszer és a hozzá szállított szoftverek, támogatnak minden szükséges párhuzamos tecnológiát. (MPI, PVM és OpenMP). Ajánlatunk tartalmazza az összes szükséges licensz szállítását.
Mind GNU, mint pedig Intel C, C++, Fortran (f77 and f90) fordítókat szállítunk a rendszerrel. Az Intel fordítók 10 konkurens felhasználót tesznek lehetővé.
SGI ProPack 7 szoftvercsomag, amely az alábbi komponenseket tartalmazza:
Gyorsító alkalmazások:
Cpusets (memória és cpu kihasználás optimaléizálása)
NumaTools (adatelhelyező eszköz)
Linkless Flexible File I/O (FFIO) (I/O teljesítmény növelés)
SGISolve Fast Sparse Solvers
Párhuzamos programozás
SGI Message Passing Toolkit (MPI-2 compliant)
SGI MPI PerfBoost alkalmazás gyorsítás a Platform MPI, Intel MPI, Open MPI alkalmazásokhoz
Perfcatcher MPI profiling tool
Easy launch of MPI Apps with Array Services and Secure Array Services
SHMEM message passing API
XPMEM cross partition support
UPC Compiler for Altix UV systems
Real-Time Performance
SGI REACT for Linux hard real-time performance
SGI Linux Trace debugger for real-time apps
Rendszerer erőforrás menedzsment
Performance Co-Pilot system performance monitoring
Comprehensive System Accounting
Accurate shared memory measurement
XVM volume management tool to stripe a volume across multiple physical disks